Με αφορμή την επίθεση στο αμερικάνικο προξενείο στη Βεγγάζη και το θάνατο του Αμερικάνου πρέσβη καθώς και τριών ακόμη διπλωματών , το νέο καθεστώς επιχειρεί εκ νέου να θέσει υπό τον έλεγχό του τις διάφορες μιλίτσιες των αντικανταφικών, που βρίσκονται διάσπαρτες στη χώρα και αποτελούν μεγάλο πονοκέφαλο για τη νέα κυβέρνηση της χώρας και τους δυτικούς ιμπεριαλιστές πάτρωνές της.
Την Κυριακή 23 Σεπτεμβρίου, ο πρόεδρος της χώρας Μοχάμεντ Ελ Μεγκαρέφ κάλεσε τις διάφορες μιλίτσιες είτε να διαλυθούν είτε να ενταχθούν στον εθνικό στρατό, ο οποίος σε ένα μεγάλο μέρος του αποτελείται από μιλίτσιες πρώην αντικαθεστωτικών. Την ίδια μέρα, χιλιάδες οργισμένοι διαδηλωτές επιτέθηκαν στο κέντρο διοίκησης της ισλαμικής οργάνωσης Ανσάρ Αλ Σαρία στη Βεγγάζη, που κατηγορείται ότι είναι πίσω από την επίθεση στο αμερικάνικο προξενείο, παρόλο που η ίδια το αρνείται, και το κατέστρεψαν ολοσχερώς. Βέβαια, σύμφωνα με πολλές καταγγελίες, πίσω από την επίθεση στα γραφεία της οργάνωσης βρίσκονται στρατιώτες του κυβερνητικού στρατού και άλλων μιλιτσιών εχθρικών προς την Ανσάρ Αλ-Σαρία.
Υστερα απ’ αυτό το γεγονός, μέλη της οργάνωσης εκτέλεσαν στρατιώτες και στελέχη του στρατού ως απάντηση στην επίθεση που δέχθηκαν, ενώ απέσυραν τις δυνάμεις τους στην έρημο προκειμένου να γλιτώσουν την καταστολή που εικάζεται ότι θα δεχθούν από την κυβέρνηση. Την ίδια τακτική ακολούθησαν κι άλλες ένοπλες ομάδες αντικανταφικών, οι οποίες δεν είναι τόσο ισχυρές ώστε να μπορούν να παίξουν με αξιώσεις στο παιχνίδι για τον έλεγχο της εξουσίας στη Λιβύη. Παράλληλα, πολλά στελέχη του στρατού έχουν απαχθεί τον τελευταίο καιρό και κρατούνται από μιλίτσιες, ώστε να χρησιμοποιηθούν ως διαπραγματευτικό μέσο σε μια ενδεχόμενη προσπάθεια του νέου καθεστώτος να τις διαλύσει βίαια.
Παρά το γεγονός ότι οι ισλαμικές μιλίτσιες, με ισχυρότερη την Ανσάρ Αλ-Σαρία, δεν φαίνεται να απολαμβάνουν τη στήριξη του λιβυκού λαού σε μεγάλο βαθμό, συνεχίζουν να στρατολογούν εκατοντάδες νέα μέλη και να εξοπλίζονται εντατικά μέσω του λαθρεμπορίου όπλων που ανθεί στη Λιβύη. Στο μεταξύ, σε μια επίδειξη δύναμης στη Βεγγάζη την επόμενη μέρα από την καταστροφή του κέντρου διοίκησής της Ανσάρ Αλ-Σαρία, χιλιάδες υποστηρικτές της συγκεντρώθηκαν στο κέντρο της πόλης διαδηλώνοντας τη στήριξη τους στην οργάνωση. Παράλληλα, μέλη της κατατάσσονται μαζικά στον εθνικό στρατό και σε άλλες μονάδες Ασφάλειας, με στόχο να καταλάβουν κρατικά πόστα. Την Τρίτη 25 Σεπτεμβρίου, ένοπλες ομάδες που διαδήλωναν έξω από το κοινοβούλιο ενάντια στην ανακοίνωση του προέδρου για διάλυση των μιλιτσιών συγκρούστηκαν ένοπλα μεταξύ τους, διαλύοντας για πολλοστή φορά την εικόνα ασφάλειας στη χώρα που προσπαθεί να στήσει η νέα κυβέρνηση.
Ωστόσο, η κυβέρνηση-μαριονέτα των Αμερικάνων δείχνει ιδιαίτερα απρόθυμη να κάνει πράξη τις πύρινες εξαγγελίες της και να συγκρουστεί ένοπλα με τις μιλίτσιες, αφού αυτό ουσιαστικά θα σημάνει ένα νέο πόλεμο στο εσωτερικό της χώρας, τον οποίο δεν είναι καθόλου σίγουρη ότι μπορεί να κερδίσει. Δεν είναι λίγες εξάλλου οι φορές που ο κυβερνητικός στρατός τράπηκε σε άτακτη φυγή κατά τη διάρκεια σύγκρουσής του με ομάδες ένοπλων αντικανταφικών.